GEO、TCGA、Oncomine数据挖掘教程

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GEO、TCGA、Oncomine数据挖掘教程

资源简介：

本课程相比市面上很多其他数据挖掘教程有很大优势，集合了GEO、TCGA、Oncomine三大数据库，从基础到高阶，既有基础的数据库介绍，也有R软件和perl等高阶工具的应用，带大家玩转基因数据，从最简单的数据下载到最后我们绘制一张5年生存率，这桌饕餮盛宴，一定符合大家的口味，一定让大家觉得物超所值！

课程目录:

【网易云课堂-1003590011】GEO、TCGA、Oncomine数据挖掘教程

• 课时1 数据挖掘概述.mp4
• 课时10 TCGA数据整理和基因注释.avi
• 课时11 寻找差异基因和制作5年生存率.avi
• 课时12 Oncomine概述及Meta分析.avi
• 课时13 Oncomine之差异分析及共表达分析.avi
• 课时14 非cel格式GEO芯片数据分析.mp4
• 课时2 GEO在线工具的应用.avi
• 课时3 GEO数据下载和数据质量分析.avi
• 课时4 原始数据预处理.avi
• 课时5 寻找差异基因及制作热图和火山图.avi
• 课时6 富集分析.avi
• 课时7 KEGG分析.avi
• 课时8 蛋白互作网络.avi
• 课时9 TCGA数据下载.avi
• 数据挖掘代码
  • 代码
    • GEO.txt
    • TCGA.txt
    • perl
      • ensemblToSymbol.pl
      • mRNA_merge.pl
      • putFilesToOneDir.pl
      • survival_time.pl
    • 资料（脚本及源码）
      • GEO.txt
      • GEO中非cel文件脚本.txt
      • TCGA.txt
      • perl
        • ensemblToSymbol.pl
        • gb2symbol.pl
        • mRNA_merge.pl
        • probe2symbol.pl
        • putFilesToOneDir.pl
        • survival_time.pl

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